Bán hàng online trên nhiều sàn thương mại điện tử phải kê khai và quyết toán thuế thế nào?

14/03/2026 - 13:004 phút đọc

(Banker.vn) Nhiều hộ kinh doanh bán hàng trên Shopee, TikTok Shop, Facebook lúng túng với quy định thuế mới khi doanh thu phát sinh từ nhiều nền tảng.

Trước kỳ kê khai thuế đầu tiên theo quy định mới, nhiều hộ kinh doanh bán hàng online vẫn lúng túng trong việc thực hiện nghĩa vụ thuế. Các vấn đề được quan tâm gồm: sàn thương mại điện tử đã khấu trừ và nộp thuế thay thì hộ kinh doanh có cần kê khai lại hay không, có phải lập bảng kê hàng tồn kho, cũng như cách tổng hợp doanh thu khi bán trên nhiều nền tảng khác nhau.

margin: 15px auto;" />

Việc chuyển từ hình thức thuế khoán sang cơ chế kê khai đang khiến nhiều hộ kinh doanh, đặc biệt là những người bán hàng online đa kênh, gặp không ít khó khăn trong giai đoạn đầu áp dụng. Một hộ kinh doanh bán hàng trên sàn Shopee với doanh thu hơn 3 tỷ đồng mỗi năm cho biết đang băn khoăn về việc sàn đã khấu trừ và nộp thuế thay thì liệu hộ kinh doanh có cần lập biên bản kiểm kê hàng tồn kho và thực hiện kê khai thuế hay không.

Theo bà Nguyễn Thị Thu Hà, đại diện Ban Chính sách thuộc Cục Thuế, căn cứ Luật số 109 và Nghị định 68, nếu trong năm 2026 hộ kinh doanh có doanh thu trên 3 tỷ đồng thì phải nộp thuế thu nhập cá nhân theo phương pháp tính trên thu nhập chịu thuế. Theo đó, số thuế phải nộp được xác định bằng thu nhập tính thuế nhân với thuế suất 17%, trong đó thu nhập tính thuế được tính bằng doanh thu sau khi trừ các chi phí hợp lệ.

Đối với trường hợp bán hàng trên sàn thương mại điện tử có chức năng thanh toán và sàn đã thực hiện khấu trừ, nộp thuế thay cho người bán, hộ kinh doanh không phải kê khai thuế trong kỳ. Tuy nhiên, đến cuối năm vẫn phải thực hiện quyết toán thuế theo quy định.

Để phục vụ cho việc quyết toán, các hộ kinh doanh có doanh thu trên 3 tỷ đồng vẫn phải lập bảng kê hàng tồn kho theo quy định tại khoản 4 Điều 18 Thông tư 68 và nộp kèm với tờ khai thuế quý I. Trong trường hợp sàn đã khấu trừ thuế, phần số thuế phải nộp trên tờ khai có thể để trống, song bảng kê tồn kho vẫn phải được đính kèm. Đây là cơ sở quan trọng để cơ quan thuế xác định thu nhập tính thuế trong năm.

Ông Mai Sơn, Phó Cục trưởng Cục Thuế cho biết, quy định lập bảng kê hàng tồn kho chủ yếu áp dụng đối với hàng hóa không có hóa đơn, chứng từ đầu vào. Nếu hàng hóa có hóa đơn đầy đủ thì hộ kinh doanh không nhất thiết phải áp dụng cách xác định tồn kho theo phương pháp này.

Một vấn đề khác được nhiều hộ kinh doanh quan tâm là trường hợp đầu năm 2026 ước tính doanh thu dưới 3 tỷ đồng nên áp dụng phương pháp tính thuế theo doanh thu nhân với thuế suất. Tuy nhiên, đến quý III hoặc quý IV doanh thu thực tế vượt ngưỡng 3 tỷ đồng thì có phải chuyển phương pháp tính thuế ngay trong năm hay không.

Theo ông Mai Sơn, Nghị định 68 đã tính đến tình huống này để đảm bảo sự ổn định cho hộ kinh doanh. Nếu doanh thu thực tế trong năm vượt mốc 3 tỷ đồng thì hộ kinh doanh không phải thay đổi phương pháp tính thuế giữa chừng mà sẽ áp dụng phương pháp mới từ năm tiếp theo.

Trong trường hợp năm 2025 hộ kinh doanh có doanh thu trên 3 tỷ đồng nhưng sang năm 2026 doanh thu thực tế giảm xuống dưới mức này thì việc xác định phương pháp tính thuế sẽ căn cứ vào doanh thu thực tế của năm 2026, không phụ thuộc vào doanh thu của năm trước đó.

Đáng chú ý, các hộ kinh doanh có doanh thu từ 500 triệu đồng đến dưới 3 tỷ đồng vẫn có quyền lựa chọn phương pháp tính thuế theo thu nhập tính thuế nhân với thuế suất nếu thấy phù hợp với khả năng quản lý sổ sách và theo dõi chi phí.

Trên thực tế, nhiều hộ kinh doanh hiện bán hàng đồng thời tại cửa hàng, trên mạng xã hội như Facebook và trên các sàn thương mại điện tử như Shopee hoặc TikTok Shop. Trong trường hợp này, cách xác định doanh thu để tính thuế cũng là vấn đề được nhiều người quan tâm.

Theo ông Mai Sơn, đối với các sàn thương mại điện tử có chức năng đặt hàng và thanh toán trực tuyến, sàn sẽ thực hiện khấu trừ và nộp thuế thay cho hộ kinh doanh. Trong khi đó, đối với các kênh bán hàng không có chức năng thanh toán trực tuyến hoặc bán trực tiếp tại cửa hàng, hộ kinh doanh phải tự kê khai và nộp thuế.

Đến cuối năm, hộ kinh doanh phải tổng hợp toàn bộ doanh thu từ tất cả các nguồn, bao gồm doanh thu từ cửa hàng, mạng xã hội và các sàn thương mại điện tử. Nếu tổng doanh thu từ 3 tỷ đồng trở lên thì số thuế phải nộp sẽ được tính theo phương pháp doanh thu trừ chi phí, sau đó trừ tiếp phần thuế mà các sàn đã khấu trừ và nộp thay.

Trong trường hợp số thuế đã nộp thay lớn hơn số thuế phải nộp theo quyết toán, hộ kinh doanh có thể được hoàn thuế theo quy định. Để thuận tiện cho việc quản lý và tổng hợp doanh thu từ nhiều kênh bán hàng khác nhau, nhiều hộ kinh doanh hiện đã sử dụng các giải pháp công nghệ hỗ trợ theo dõi doanh thu và đối soát dữ liệu. Các hệ thống này giúp tổng hợp doanh thu theo từng địa điểm kinh doanh và hỗ trợ quá trình quyết toán thuế cuối năm được chính xác hơn.